Al iniciar aplicaciones las lanza atras de las que se esta ejecutando

Hola , esto es algo que me incomoda un poco.

A partir de que instale la 2009.1 dual-arch x64 y trabajando sobre gnome ( me gusta el cubo y con kde no es muy buena la relación kde-compiz),cada vez que quiero abrir una aplicación esta se ejecuta detrás de la que se este ejecutando con anterioridad, es decir si tengo Mozilla-Firefox ejecutandose , y quiero abrir el correo (thunderbird ) o el Virtual-Box estos se ejecutan bien, pero atrás del firefox .

Hasta ahora lo que hago es girar el cubo a algun escritorio vacío y ahi ejecutarlo.

Pero lo que me mata a veces es que abre preguntas detrás del programa principal y como estas no se muestran en el panel, pues parece que el programa se congelo, siendo que esta esperando respuesta...

Si alguien tiene una idea de como corregir esto, se los agradeceré, ya que me harian la vida más sencilla .

Saludos